近几年，益生菌食品产业出现细分化趋势，针对减脂减重、情绪管理、口腔健康、呼吸道健康等特定目标的产品不断上市，并受到消费者青睐。对此，中国保健协会保健咨询服务工作委员会秘书长王鹤松表示，消费者一般有健康需求时才会食用益生菌食品，健康状况改善后就会停止食用。其实，益生菌需要从食物中进行补充，而且适宜长期食用。

中国医学科学院、北京协和医学院副研究员吴崇明则强调：目前，益生菌食品存在品类界限模糊、缺少标准规范、品牌认知度低、同质化严重等问题。近年来，虽然有大量益生菌新产品上市，但很多产品所添加的菌种并非真正意义上的益生菌，大多为益生菌的增殖辅助物质，无法产生相应的效果。某些益生菌食品中还存在掺杂掺假现象，比如在菌粉中加入外表相似的粉末、菌液中加入死菌、活菌数目不达标等。

吴崇明建议，消费者选购益生菌食品时应关注菌种来源、菌株备案、活菌数目，并通过正规渠道购买。同时，我国益生菌食品企业应与科研单位、医院相结合，从益生菌菌种的培养、功效挖掘和验证等多方面入手，注重产品的安全性、稳定性、有效性和持久性，大力研发我国特有的益生菌食品。

吴崇明表示，益生菌的作用与剂量密切相关，摄入足够剂量的益生菌才能达到相应的效果，但不同的菌株发挥健康作用时的剂量不同，活菌数也并非越多越好。益生菌功能的发挥存在人群特异性，虽然益生菌产品对大多数人群的健康确实存在益处，但仍不能确定其对所有人群的健康都有益处，且没有任何副作用。

“益生菌食品必须保证活菌状态和必要数量。”，在益生菌食品产业发展中，生产企业应充分利用荧光显微、流式细胞、宏基因组分析、特异性PCR等技术，确定产品中的菌种组成以及对活菌进行..计数，从而提升产品评价、质量控制及市场监管水平。